步进电机的噪声不可避免，但可以控制其使用条件和控制方式来相对减小噪声。电机噪声的产生主要有两个方面：固有噪声和共振。 固有噪声：电机在转动的过程中，机械结构的相互接触产生。不可能消除，但是通过一些方法可以在一定程度上减小噪声。调整负载或驱动电流，避免由于负载过大（过小）引起电机失步（跃步）引起的噪声；采用细分驱动的方式，使电机电流的变化尽量以接近余弦曲线变化，减少由于电流变化引起的输出扭矩的波动，导致一些噪声；
共振引起的噪声：由于电机存在一定的共振区域，在此速度区间使用，将会引起电机共振，产生噪声。因此，对于共振引起的噪声，应避免电机在共振区附近运行；当电机从较低的共振区加速，应尽量快地加速，远离共振区域，减小噪声。