1、粗滤
粗滤是食品饮料加工中过滤系统的步，主要是去除较大的颗粒和悬浮物。粗滤一般采用袋式过滤器，选用100-300目的尼龙网袋。粗滤后仍然会成浑浊状，静置后也会有沉淀。此环节成本低廉，可为后续的精滤提供保护，延长精滤设备的使用寿命。
2、精滤
精滤是食品饮料加工中过滤系统的重要环节，主要是去除0.1微米以上的微小粒子。精滤一般采用微孔滤膜芯式过滤器、硅藻土过滤器。精滤后产品即可澄清透明，但是一些有大分子蛋白的产品净置后仍会有一些微小絮状物呈现，这就需要更精细的过滤环节——超滤。
3、超滤
超滤是食品饮料加工中过滤系统的补充环节，主要是去除大分子粒子。一般采用ro膜芯式过滤器。精滤后可去除0.0001微米的大分子微粒。超滤后外观效果澄清，但同时也会去除产品中的一部分蛋白营养。使用成本也较高。