锈病是红豆草上重要病害，在我国甘肃、新疆、山东等省区都有发生，严重影响牧草产量和品质。
症状可为害叶片、叶柄、茎杆、花梗及荚果等。受侵部初生很小的棕红色夏孢子堆，突破表皮外露，呈粉末状，后期出现大量黑褐色粉末状的冬孢子堆。病株上有大量叶片、小花和未充分发育的荚果提前脱落。
病原uromycesonobrychidislev.称红豆草单胞锈菌，属担子菌亚门真菌。夏孢子卵圆形，淡黄褐色，壁有细刺，具3-5个芽孔，大小为19-26μm×16-20μm。冬孢子球形或卵圆形，壁较薄，上具稀疏而不明显的刺，顶端有明显的近于无色的乳突，大小为21-24μm×18-19μm，柄短无色。锈子器未知，转主寄主也尚不明确，有人认为是大戟属（euphorbiaspp.）。侵染多种红豆草，但不侵染苜蓿、三叶草、草木犀、羽扇豆等其他豆科植物。
发病特点病原菌借冬孢子或休眠菌丝在病残体或多年生寄主病株上越冬，成为次年发病的初侵染源。较温暖地区夏孢子也可越冬。生长季节病株上产生的夏孢子借风传播，在草地上造成多次再侵染。条件适宜时，每5-10天就可发生一代夏孢子，从而使病害迅速蔓延。孢子必须在水滴中萌发，故多湿有利于此病流行。草层稠密和倒伏的草地发病较重，年代较久的草地发病也较重，混播和宽行播种可减轻发病。
防治方法
（1）因地制宜选育和种植抗病品种。
（2）加强草地管理。
留种地宽行播种，刈割草地建议与禾本科牧草混播；科学施肥，增施磷钾肥，提高植株抗性；适时灌溉，注意雨季排水；重病草地就应尽快刈割以减少侵染源，且不能留种。
（3）药剂防治。
科研地可选用适当的杀菌剂保护，如用胶体硫等保护草地，可使小叶发病率明显减少。