软腐病为百合的常见病，分布广泛，发生普遍。保护地、露地都发生，通常病株零星，对生产影响较小，严重时发病率可达20%以上，显著影响百合产量与品质。
症状 此病可为害叶片、茎基和鳞茎。叶片染病，呈水浸状绿褐色坏死腐烂。茎基染病，呈不规则水浸状灰褐至暗褐色坏死，迅速扩展致病部以上萎蔫枯死或倒折。鳞茎染病，初出现灰褐色不规则水浸状斑，逐渐扩展向内蔓延湿腐，终致整个球茎腐烂呈糊状，散发出恶臭气味。
病原 病原为匍枝根霉(rhizopus stolonifer (ehrenb.ex fr.)vuill.)及黑根霉(r.nigricanns ehrenb.)，隶属接合菌亚门、接合菌纲、毛霉目、根霉属真菌。
发病规律 病原菌广泛存在于自然界，以孢囊孢子从伤口侵入植株鳞片，在植株体内形成菌丝体，菌丝体向下可达鳞片基部，再由此侵入其他鳞片。在温暖多湿、通气不良的贮运环境下，该病蔓延迅速，鳞茎很快腐烂。病原菌寄生性弱，致病性很强，可导致许多多汁蔬菜、果实、贮藏器官腐烂。
防治方法
1.选择排水良好、地势较干燥的地块种植，施用充分腐熟的有机肥。
2.生长期避免造成伤口，防止田间积水，适时防治好根蛆，挖掘鳞茎时尽可能避免碰伤鳞茎，减少侵染。
3.发病初期可以先使用喷克菌800-1000倍液或必菌鲨1000倍液或高锰酸钾进行消毒，间隔一天再用72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，每7-10天一次，连续2-3次即可。