车前草的主要病害有“车前草穗枯病”和“车前草菌核病”。
车前草穗枯病主要发生在穗部，穗部从上至下逐渐侵染，呈黑褐色坏死。病菌可随风雨传播，发生较普遍，为害较严重，直接影响到车前草的产量和质量。车前草菌核病主要发生在基部叶片和穗轴，在叶片基部,去年的病源（菌核）长出白色菌丝侵染叶片，叶片被侵染后呈水渍状腐烂，上面继续长白色菌丝，然后交结呈黑色菌核，继续侵染。后期造成穗轴为害，受害部位呈红褐色，严重的倒伏（南风病）。随着温湿度的增加，会引起病害的进一步蔓延。
防治方法：
1．开沟排水做到雨停不积水，降低田间湿度。
2．清除车前草基部病叶、老叶、烂叶（贴地叶片），菌核清除，剪除车前草黑色穗、死穗，带出田外集中销毁。
3．药剂防治，在3、4月，亩用40%火把可湿性粉剂4包，每包兑水一桶，或80﹪乙蒜素，奥普安轮换使用。施药时要求均匀，叶片的正反面及穗部要喷透，以提高防治效果，7天后的睛天再喷药一次，如基部感病仍需在喷药前清除。