土壤是病虫害传播的主要媒介，也是病虫害繁殖的主要场所。许多病菌、虫卵和害虫都在土壤中生存或越冬，其中还常存有杂草种子。因此，不论是苗床用土、盆花用土，还是露天圃地，种植前都应彻底消毒，家庭养花也不例外。花卉土壤消毒的常用方法有以下几种：
1、日光消毒：将配制好的培养土放在清洁的混凝土地面上、木板上或铁皮上，薄薄平摊，暴晒3-15天，即可杀死大量病菌孢子、菌丝和虫卵、害虫、线虫。用此法消毒虽然不尽彻底，但最为方便。
2、蒸汽消毒：把营养土放入蒸笼或高压锅内蒸，加热到60-100℃，持续30-60分钟（加热时间不宜太长，以免杀死能分解肥料的有益微生物，影响土壤肥效），可杀灭大部分细菌、真菌、线虫和昆虫，并使大部分杂草种子丧失活力。
3、水煮消毒：把培养土倒入锅内，加水煮开30-60分钟，然后滤干水分，晾干到适中湿度即可。
4、火烧消毒：保护地苗床或扦插、播种用的少量土壤，可放入铁锅或铁板上加火烧灼，待土粒变干后再烧0.5-1小时，可将土中的病虫彻底消灭干净。
5、药剂处理：家庭中可以使用不同的药剂，对土壤进行熏蒸处理，即把土壤过筛后，一层土壤喷洒化学药剂，再加一层土壤，然后再喷洒一次药剂，最后用塑料薄膜覆盖，密封5-7天，然后敞开换气3-5天即可使用。常用的药剂有甲醛、代森锌、多菌灵、硫磺粉等。