扁桃定植时间可分为秋季和春季两个时段。一般多采用秋季定植，因为秋季定植的果树，根系伤口愈合早，翌年根系生长也早，苗木生长势旺盛。但有些过于寒冷的地区或多风干旱的地区也可以在春季栽植。
扁桃生长旺盛，一般栽植密度为每亩33－55株（美国17－30，甚至更稀），即栽植株行距3米×4米或者4米×5米。当然若要获得早期更多的产量，可以有计划的密植栽培，待结果3－4年后进行适当的间伐。
定植采用成品苗、芽苗、速成苗均可，但不同苗木各有优缺点。利用芽苗建园，可省去一年的育苗时间，便于整形，但需保留一些预备苗，用于随时补栽。采用成品苗定植，整形带内应有较多未萌发的叶芽，定干后易发出强旺枝。
栽植前，先按确定的株行距测定好栽植点，然后以点为中心挖定植穴，定植穴大小以80厘米见方或多100厘米见方为宜。挖定植坑时，将表土和下层土分开堆放。挖好定植坑后，每穴施腐熟优质有机肥10－20千克，与表土拌均后，填入定植穴中，一边填一边踩，填到一定位置，放入苗木，接着填土，并提苗顺根，再踏实，使根系与土密接。苗木栽植深度与在苗圃时的深度相同。栽植好后及时灌水，水下渗后，覆土保墒。栽植的苗木，如果是经过长途运输或假植的苗木，在栽植的前一天应将根系在水中浸泡12小时，让其充分水，还要对根系进行修剪，将断根毛茬剪齐，这样会促发新根，提高成活率。
栽植后根据干高的要求，在饱满芽处将多余的枝干上部全部剪掉。促使整形带内的芽及早萌发。在寒冷及风特别大的地区，秋季栽植的苗木，应在土地上冻前将苗木按倒埋土，待树木发芽后，再将土扒开扶正苗木。