秋冬季节是盆栽花卉营养积累和花芽分化的关键时期。此时的管理工作直接影响到花卉越冬防寒能力及翌年开花，需做好以下工作：
防寒：根据花卉的生长习性和对温度的需求，确定适宜的入室时间。冬季休眠的花卉，如月季、石榴、荷花等应放置于3℃至5℃的室内；冬季半休眠的花卉，如桂花、栀子花、山茶花等应放置于5℃以上的冷温室内；冬季仍继续生长的花卉，如四季海棠、香石竹等应放置于8℃至10℃的温室内才可安全越冬。
修剪：月季、扶桑、一品红、木芙蓉、金橘、代代等在当年生枝上开花的花木，应在冬季休眠期修剪，促其多发新梢、多开花、多结果；多年生的藤本花卉，剪除过密枝、重叠枝及病虫枝；观赏枝干的灌木，如红瑞木等，选择靠近骨干枝的新梢进行重短截，使其抽生新的枝条。
松土：通风不良会使呼吸作用受阻，影响花卉的正常生长甚至死亡。应及时松土，保持盆土疏松。
施肥：及时对花卉施肥，施肥后盆土干旱应及时灌水。此外，可结合喷药进行根外追肥，以补充花卉营养。常用的追肥有0．5％尿素、1％过磷酸钙、0．3％硫酸钾。
喷药：初冬季节，温度降低病虫害活动减少，但也应及时防治。应重点防治叶片穿孔病、蚜虫、红蜘蛛及潜叶蛾等病虫害。一般可选用50％多菌灵800倍液加40％乐果乳油1500 倍液，或50％退菌特可湿性粉剂600倍液加40％水胺硫磷1000 倍液等药剂防治。