造成马莲小枣落花落果的主要病虫害有枣锈病、炭疽病、枣芽象甲、枣瘿蚊、金龟子、绿盲蝽和桃小食心虫等。防治措施，萌芽后喷l次2000～3000倍菊酯类农药，杀灭枣芽象甲、枣瘿蚊、枣尺蠖等，以后根据害虫发生情况再喷1～2次。6月上旬人工捕捉金龟子，利用其假死性振树捕捉。利用频振式杀虫灯捕捉，并做好预测预报绿盲蝽及其他害虫的发生期。6月中旬至7月下旬用溴氰菊酯5000倍液、灭扫利600倍液、蚧虱净2000倍液、桃小灵1000倍液防治龟蜡蚧和桃小食心虫等。多雨年份及时喷布波尔多液、菌毒清等，每隔10～15天1次，连喷5～7次，预防浆果病、枣锈病。8月上旬至9月上旬喷布桃小灵或菊酯类农药，7～10天1次，连喷2～3次，防治桃小食心虫和黄莉蛾等。有锈病、浆果病发生时加复方多菌灵或菌毒清，有缩果病发生时，间隔1周连喷两遍70～140单位／l农用链霉素，防治效果明显。