生石花肥厚多肉，含水量很高，很容易因感染细菌而引起植株腐烂，因此应注意通风良好，避免盆土积水，经常喷洒多菌灵、甲基托布津之类的灭菌药物，平时每月喷一次，夏季和脱皮期可增加喷药次数以及用药量，最好几种药物交替使用，以免产生抗药性。若发生腐烂病应及时将发病的植株清除，以免病菌蔓延，感染其它健康的植株。
生石花的主要虫害是根粉蚧，附着在根部吸取植株的养分，从而造成植株表皮发皱，生长停滞，不开花，也不分头，严重时还会造成植株干瘪死亡。如果发生根粉蚧可将有虫害的根部剪除，晾3～5天后再用消过毒的新培养土栽种。
此外，鸟类、老鼠等也会啄食或啃食生石花肥厚的肉质叶，在植株上留下难看的疤痕，如果伤口未干燥之前进水，还会造成植株腐烂，可加防护罩进行预防。