超声波细胞破碎仪是设备由主机、换能器、杯式探头（即非接触式探头）、样品旋转部件、可透视消音箱和循环水浴等几个部分组成。除了适于chip或者chip-seq实验外，也可作为普通的超声破碎仪用于常规细胞破碎、裂解实验，并有多种接触式、非接触式探头供选配，适用于不同实验体系。
超声波细胞破碎仪操作前超声程序设定方法：
1、按样品量的多少选择适当的容器（试管或各种烧杯），固定或安装好，条节振动系统位置，使变幅杆末端插入样品液面10-15mm并使其在容器的中心位置，不得接触容器壁。
2、超声程序设定方法：
1)间隙时间设定：按设置键，显示窗-1，说明进入间歇时间设定状态，此时显示窗口所显示的是原始数据或“——”（以下同），此次输入数据单位为秒。
2)工作时间设定：间歇时间设定完成后，按设置键，显示窗-2，说明进入工作时间设定状态，此时显示窗口所显示的是原始数据，此次输入数据单位为秒。工作时间在10秒以下。
3)温度保护设定：按设置键，显示窗-4，说明进入温度保护设定状态，此时显示窗口所显示的是原始数据，按键即可设定保护温度（0-50℃）。
4)全程时间设定：按设置键，显示窗-3，说明进入全程时间设定状态，此时显示窗口所显示的是原始数据，按键即可设定全程工作时间。
3、超声程序设定就绪后，即可按开关开机。按下电源开关，此时电源指示灯亮，再按一次保护复位按扭及工作复位按扭，待设定的间隙时间过后，即进入震荡状态，将功率调节旋扭慢慢向顺时针方向转动，调至所需的功率位置上，以达到理想的工作效果，待设定的总工作时间过后显示屏显示所设定的总时间。一切处于停振状态，如需重复上述实验，可再按工作复位按扭，如不 重复，应关机，并切断电源。
4、如在工作时保护指示灯亮，说明仪器的功率开的太大，而进入保护状态，用旋扭1减低功率，按一次保护复位按键及工作复位按键，即开始工作。