磁力搅拌器的不足之处：从低温端到恒温需要经历较长时间，在此过程中加热体需要全功率运行，将在加热表面形成较高温度，可达400度甚至更高，此时磁性材料将降低磁场强度，出现搅拌子跳子现象，甚至干脆不动，仪器无法使用。功耗大，使用寿命较短。磁力搅拌器的优点：温升稳定，无过冲现象，对容器无外观要求，加热均匀，在200度以下可以使用普通搅拌子，对下端磁铁基本无影响，功耗小，电能利用率较高。
磁力搅拌器使用方法：接通电源，盛杯准备就绪，打开不锈钢容器盖，将盛杯放置不锈钢容器中间，往不锈钢容器中加入导热油或硅油至恰当高度，将搅拌子放入盛杯溶液中。开启电源开关，指示灯亮，将调速电位器按顺时针方向旋转，搅拌转速由慢到快。调节到要求转速为止。要加热时，连接温度传感器探头，将探头夹在支架上，移动支架使温度传感器探头插入溶液中不少于5厘米，但不能影响搅拌。开启控温开关，设定所需温度，按控温仪上 、-设置需恒温温度，表头数字显示数值为盛杯中实际温度，加热停止，自动恒温，该仪器可长时间连续加热恒温。如工作中搅拌子出现跳子现象，请关闭电源后重新开启，速度由慢到快，调节便可恢复正常工作。