离子色谱是分析阴离子和阳离子的有效方法，比其他方法更简单快速，灵敏度更高，选择性也更好。这些特点让离子色谱近年来得到了快速发展。运用离子色谱法进行分析时，结果的准确性受到很多因素的影响，了解这些因素对分析结果的影响才能提高分析的准确性。
1.环境因素
对于温度的变化而言，往往会产生一种柱压变化，温度变化1℃，压力将会发生680~1100 kpa的变化，其中，*在压力变化时会自动调整流速，使出峰保留时间发生一定的变化。而在实际的温度升高过程中，其保留时间将会不断减少，而柱效则会显著增加。
在离子电导函数中，温度作为一种主要影响因素，一旦升高1℃，电导响应值就会在某种程度上增加2%左右。
一旦温度较低，系统的压力较大，就会影响系统的实际使用寿命。
2.实验用水
水的纯度分析是工作的一个关键环节，因为在离子色谱分析的过程中，要结合试验用水的纯度分析合理配置淋洗液。在配置标准溶液的过程中，要尽可能地使用新制备的超纯水。
3.标准溶液的配制和保存
标准溶液的浓度直接关系着样品分析结果的准确性。在配置工作标准溶液的过程中，要保证保存期低于一周，而混合工作标准溶液要在当天试验过程中配制。
4.淋洗液
在离于色谱分析的过程中，淋洗液的浓度和流速往往是改变峰面积和峰高的重要因素。
5.样品前处理
在实际的分析过程中，往往需要稀释样品浓度。在稀释100倍之后进行分析，然后结合实际的稀释结果合理选择稀释倍数。样品前处理还需尽可能地减少超柱容量，以免强行保留时间对柱子造成污染，并全面增加分离度，减少基体离子的干扰。