离子色谱仪在大气环境检测中主要是对大气中的氯化氢和硫酸雾有害气体的含量进行检测。在正常的环境下，氯化氢和硫酸雾在大气中的含量十分稳定，但是，如果在自燃现象中有更多的垃圾存储或倾倒垃圾的地方，那么此时空气中氯化氢的含量将大大增加，氯化氢的浓度将迅速上升，对大气的影响将很大。附近的环境破坏也愈加严重，对附近的居民的身体健康以及动植物的生长有着很大危害。
一般的传统的大气环境检测方法是化学监测方法，这种方法的缺陷就是不能及时对大气中氯化氢变化做出判断，而采用离子色谱仪能够弥补这一缺陷，能够对大气中的氯化氢含量的变化及时进行检测分析，这样就可以为大气检测的有关部门进行采取合理的应对措施提供准确的数据信息。
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