穴盘规格 200、128或更大。基质洁净，排水性良好，ph值为6.2至6.5，播前将穴盘淋透。
温度 发芽期温度保持为20℃至25℃，发芽后逐渐降低至15℃至18℃。穴盘育苗后期或上盆后到开花前，必须使植株经历一段5℃至8℃的低温阶段，有利于植株顺利进行花芽分化和开花。
光照 1000lux左右的光照利于发芽整齐，出苗后，光照应逐渐增强至2.5万lux到3万lux。
水分管理 除发芽阶段和上盆之初，保持基质偏干，加强通风和光照，增强植株的抗性。
肥料 种苗专用肥20-10-20和14-0-14交替喷施，初期氮浓度为50ppm至75ppm，后期为100ppm至120ppm。植株呈现徒长态势时控制铵态氮肥的施用。
生长调控 在温度、光照、湿度保持合理水平的情况下，蓝眼菊植株生长比较健壮，很少发生徒长现象。特殊情况下，为避免部分品种植株过高，可在真叶迅速生长期用b9或pp333进行株高控制。