一般来说，玉米会由于品种、栽培条件、产量水平和自然气候不同，导致其产量发生较大的变化，而且产量三个因素的构成也有很大差异。因此，利用玉米考种系统进行玉米室内考种可以分析研究在不同条件下的合理产量结构，研究在高产条件下，争取穗大粒多粒重，进一步促进高产再高产的途径。那么利用玉米考种系统进行室内考种的要点有哪些呢？
首先，在收获后，每小区选取代表性的穗子（20穗），装入尼龙种子袋中，写好标签，标签内容包括姓名、作物名称、品种、收获日期。然后带回室内风干。
其次是果穗风干后，使用玉米考种系统进行玉米考种。先利用玉米考种系统测定穗长、穗粗、穗行数、行粒数、秃尖程度、穗重。然后把所测穗脱粒，秤出穗粒重。所有得出数据填入制式表格中。（注意：千粒重测定时，把20穗已脱粒玉米种子混合后，数100粒称重，一般重复三次，取较为接近的二次平均数，换算成千粒重。）
玉米的室内考种是现代玉米种植中的一项重要工作，因此利用玉米考种系统可以提高玉米考种的精度和效率，帮助室内考种工作的顺利进行。