根是君子兰从土壤中获得生长发育所需要的水分和养料的重要器官。君子兰播种后，在20?25摄氏度的条件下，一般15?20天胚根即可伸出。君子兰根属肉质根系，白色、粗壮，根粗0.6?1.2厘米，根长30?50厘米。
肉质根含水量高，质脆嫩，易弄伤碰断，导致根系腐烂，造成烂根现象。因此，勿伤害根系。确保君子兰根系完好，是养好君子兰的重要一环。
有人说君子兰地上部有几片叶，地下也有几条根，真的是这样吗？这话有一定道理，但也不完全对.
一般一年生之内的君子兰幼苗，其叶片数与根数是相等的，也就是说地下有一条根，地上也长一片叶。但二年生以上的君子兰，叶和根的数目就不再相同了，总的趋势是根多叶少。有时能看到具有上百条肉质根的君子兰，但却很少看到趄过40片叶的君子根茎尚有一个特点，即根的再生力根强s当根系腐烂后，即使完全无根，但只要有一个光头根茎头，只要处理得当，经一定时间后，光头根茎仍可长出新根。因此，君子兰爱好看常用这个特性，使烂根君子兰重发生机，恢复生长。