选择优良品种，是种植好银杏的重要前提。只有根据市场需要和栽培地的土壤与气候条件，搞好对品种的选择和组合，选择优良品种，才能收到良好的经济效益。选择的品种，除了要了解品种的特性外，还要考虑以下几方面：
第一，要考虑栽培目的。以生产木材为目的者，应选择干直、速生、冠窄的品种，以生产种子为目的者，则应选择种粒大，仁洁白，糯性好，有香味，出核出仁率高的品种。
第二，要从土壤和气候条件出发。在南方地区，要选用耐高湿的品种，在北方地区要选用耐旱耐寒的品种。在土壤肥沃、水源充足的园地，要选择丰产性好的品种，而在砂砾、盐碱地则宜选用抗性强、耐瘠薄的品种。
第三，要注意雌雄植株配植。银杏是雌雄异株植物，种植时应选择优良雄性株系或品种，按一定比例进行搭配。所选雄性品种应生长健壮，抗性强，无病虫害，开花多，花粉萌发率高，亲和力强，花期与主栽雌性品种基本一致。
第四，要做到早、中、晚熟品种搭配。熟期的合理搭配，可以延长市场供应时间，确保良好的经济效益，同时也有利于调节农事活动和安排劳动力，掌握生产主动性。