过滤器是净化系统的核心设备，过滤器对空气形成阻力，随着过滤器积尘的增加，过滤器阻力将随着增大。当过滤器积尘太多，阻力过高，将使过滤器通过风量降低，或者过滤器局部被穿透，所以，当过滤器阻力增大到某一规定值时，过滤器将报废。因此，使用过滤器，更要掌握合适的使用周期。在过滤器没有损坏的情况下，一般以阻力判定使用寿命。高效过滤器的更换安装：
断开安全柜的电源，挪开前部的前板，从节气闸中拔下静压测试管，卸下固定风机罩的螺钉，移出风机罩，解开螺母和螺钉，移出风机装置放在一边，以备安装新hepa过滤器使用，向过滤器表面喷射固定剂小心地将过滤器从它的安装位置取下如果需要，将过滤器材料落入安全的医疗垃圾袋中，将其密封，并贴上“危险废物”的标记，按其类型进行相应的处理；在封闭过滤器的安装区域后，将整个工作区域的密封解除；
过滤器的安装：
小心将过滤器放对位置，按照拆除部件的相反顺序重新安装风机装置。确保静压测试器的管子位置正确重新装上前部的通路嵌板插上安全柜的电源，打开送风机。检查负压通道是否处于平稳状态，所有的零部件正常运转。关掉安全柜电源。测试外排和供风过滤器，重新设置手操作区进气流量和垂直气流量更换过程结束后，应当对场地和设备进行安全性检查。测试风速、尘埃粒子。满足要求后，整个更换过滤器的工作结束。