1 离心
离心是一种常见的固液分离方法, 可以很好的除去菌体和蛋白质等大分子物质, 但由于需要较高的转速, 而且样品处理量较小, 导致设备投资和能耗很高, 不适合工业化生产。
2 膜过滤
该法是利用具有一定选择透过性的过滤介质对目标物质进行分离, 常见的有微滤、超滤、纳滤, 可根据各物质分子量的不同进行分离。发酵液的预处理一般可以利用超滤膜过滤除去发酵液中的大分子物质。
3 酵母液三效蒸发器蒸发浓缩
蒸发浓缩的作用是去除发酵液在发酵过程中多余的水分，通过双效降膜蒸发器或者三效降膜蒸发器能将物料里水分迅速的蒸发，同时不会破坏物料的活性。设备具有以下特点：设备高度高，利用泵和重力的原理，物料从上而下的闪蒸，达到蒸发的目的。2.设备设计紧凑，占地面积小，3.物料连续进料，可以节省多余的人工费用。
4 絮凝
絮凝就是通过添加絮凝剂, 使液体中不易沉降的悬浮颗粒聚集成团, 从而易于沉降。
5双水相萃取
当亲水性有机溶剂 (小分子醇和酮) 与水和无机盐以适当的比例混合时, 会出现液液分层的现象, 该双水相体系被称为新型双水相体系。在此新型双水相体系中, 发酵液中的pdo及其他醇类物质 (比如残余甘油) 主要进入有机相 (萃取相) , 而发酵液中的其他成分主要进入水相 (萃余相) , 可去除发酵液中的绝大部分菌体、蛋白质、盐以及其他杂质。