受水资源短缺的影响，市政污水和工业废水越来越多的作为再生水或回用水水源，相较于地表水、地下水等自然水体水源，这类水源的有机物含量较高。故该类水源在通过反渗透膜系统处理成生活或工业用水时，通常会因有机物污染而使得膜系统性能下降。
一﹑水中有机物的表示方法通常在水质分析中以下三个指标被用来表征有机物的污染程度。
1、化学需氧量（cod）：用化学氧化剂（重铬酸钾或）氧化水中有机污染物时所消耗的氧化剂量（以mg/l为单位），采用不同的氧化剂用不同的下标区分，例如codcr和codmn。
2、生化需氧量（bod）：是指水中有机物被好氧微生物分解时所需的氧量（以mg/l为单位），反映了水中可生物降解的有机物量。目前国内外普遍采用20℃、5天培养时间所消耗的氧作为指标，简称bod5。
3、总有机碳（toc）：总有机碳（toc）表示水中所有有机污染物的含碳量（以mg/l为单位）。由于toc仅反映有机物中碳的含量，地表水中有机物的实际含量是该值的3倍左右。
二﹑反渗透膜进水中有机物的要求及危害
反渗透膜系统进水水质有机物含量要求codcr＜15mg/l，bod5＜10mg/l，toc＜5mg/l，实际应用中进水指标往往超过规定的数值，导致膜系统的清洗频率升高。
反渗透膜系统发生有机物污染时，将造成膜系统的产水量下降，压差上升。
三﹑预防反渗透膜系统有机物污染
1、尽可能降低进水中的有机物含量，达到反渗透膜系统的进水要求。
2、系统发生有机物污染时，及时进行有效的化学清洗，恢复系统性能。