开花与采收：
为使消费者能获得高品质的百合，应大量合充分成熟但又不是过分成熟时采收。
有10个或更多花蕾的茎，要有3个花蕾着色；有5至10个花蕾的茎，要有2个花蕾着色；有5个以下花蕾的茎，至少有一个花蕾着色之后才能采收。
过早采收会导致花色苍白和一些花蕾不能开放。在花蕾已经开放时采收，又会给采收后的处理与分售带来困难。如果必要的话，应剪掉已开的花。采收时，最好剪断茎而不是连根拔出。如果拔出右合则会对其它植株的根系造成损伤，以至于如不用铁丝网支撑，百合甚至会倾倒。事实上，东方百合杂种与麝香百合杂种根系强大，根本无法拔出。
最好在早上采收百合，这样可以减少脱水。出于同样的原因，采收的百合在温室中的存贮时间应限制在30分钟以内。
分级与成束：
采收后，按茎上花蕾数目、茎长和坚硬度以及叶片与花蕾是否畸形来对茎进行分级。然后把百合茎捆绑成束，在此过程中，茎基部10厘米的叶子应被摘掉。
摘叶可以人工进行，也可使用特殊的去叶机。去叶可增加百合的观赏价值和延长其瓶插寿命。黄色的或损伤了的叶子也要摘掉。捆绑成束后，若要把百合放在水中的话，还应剪断茎。最后一步是包装，百合的包装能保护花蕾与叶片。分级和成束可以利用所谓的鲜花成束线来完成，这极大地缩短了加工过程（从采收百合到把它们放置在水中）。为了防止干缩，整个加工过程最多只能持续1个小时。
采收的百合如果不能立即分级与成束，那么最好立即把它们放进清洁的水中，再放进冷藏室。对于亚洲杂种，还可以在水中加预处理药剂。