近红外光谱分析特别是农业近红外光谱分析经常应用于复杂、天然样品的无损分析，是一种应用广泛的检测技术。在使用过程中，近红外光谱仪有时候会出现一些故障，例如光源不工作、不能开机等。操作人员需要熟练掌握常见的故障类型以及相应的排查与处理方法，以保证仪器可以快速恢复正常工作。
常见故障与处理方法
(1)不能开机：应首先检查供电系统是否有电，电源插头是否接触良好，如果都正常，就要进一步检查仪器的保险丝是否熔断，以上检查都正常的情况下，可能是仪器内部电源变压器出现损坏，需要仪器厂商的维修工程师现场进行仪器内部故障诊断与维修。
(2)光谱仪与计算机没有信号通讯：光谱仪主机开机后，与控制计算机没有通讯，应检查通讯线路是否损坏，接口是否接触不良，通讯端口是否被占用，通讯地址是否被修改，通讯板卡是否正确驱动和损坏等几个方面进行故障检查与排除，如果使用者不能自行检查，则需请仪器厂家工程师现场排查。
(3)光谱仪光源不工作：光源不工作的故障可能是光源损坏或者光源的供电电源出现故障，用万用表测量光源的电阻即可得知光源是否损坏，测定光源供电电源输出电压可以得知电源是否故障。
(4)光谱仪没有光谱信号输出：应检查仪器检测器是否有故障，信号传输线及接口接触是否正常。