自动进样器分为吸入式自动进样器，推入式自动进样器和整体样品环自动进样器三种列别。
对于吸入式自动进样器来说，样品是被注射器产生的吸力吸入样品环，这种设计的自动进样器在早期因其简单可靠而非常流行，但是后来随着另外两种设计的出现而逐渐衰退。吸入式自动进样器注射器连在废液排出口，采样针和相应的管路连接在进样口，针插入样品瓶中，接着注射器回吸知道样品*充满样品环，圆形密封垫旋转将样品进样。
吸入式自动进样器的设计较为简洁，只有采样针沿一个轴上下运动，通过旋转样品盘将所需样品瓶置于针下，然后根据需求开始进样。而吸入式自动进样器的缺点则是会有样品的浪费，因为样品在进入样品环之前首先必须充满采样针和相连的管路，所以就造成了一定程度上的样品浪费。
推入式自动进样器的设计也较为常见，这种技术和手动进样极为相似。注射器移动到样品瓶，吸入预定量的样品，再移动至进样口，将样品注入样品环。这种设计方式需要的样品量远小于吸入式设计，并且注射器的吸取和排出都是在步进马达下控制完成的，可以达到很高的精密度和准确度，正常情况下进样的结果偏差都在0.5%以下。同时，推入式自动进样器也包含了吸入式自动进样器所没有的一些功能，比如任意样品序列、多溶剂清洗功能、智能程序化进样等，满足了实验室分析的不同进样需求。
整体样品环自动进样器，比较适用于样品量有限的痕量分析，基本上没有样品的浪费。其运行过程相对于以上两种较为复杂。整体样品环自动进样器的整个进样过程中，样品只存在于清洗过的样品环内，所以全部样品都被进样，不会造成浪费，大进样体积取决于样品环容量。