（一）采收
根茎繁殖的 射干于栽后翌年采收，采取育苗定植的则在第三年采收。常在10月下旬或11月上旬射干植株全部枯死时进行。先除去茎秆，而后用四齿耙在每株离茎基外围5厘米左右的地方挖1圈后，再将全蔸挖起，抖掉泥土，运回加工。
（二）留种
选2年生生长健壮、无病虫害植株的地块作射干种子田。对种子田的管理，在一般大田管理的基础上，于7月中旬增施1次磷钾肥，每亩施过磷酸钙25千克，氯化钾10千克，促使花盛果多，子粒饱满。9月下旬至10月上旬，将果壳变黄色将要裂口时的果实连果柄剪下，置室内通风处晾干后脱粒。切勿曝晒，曝晒会加重种皮的坚硬性，对种子发芽不利。然后将种子与3倍清洁湿润的河沙混合均匀，放入木箱内或室内阴凉地面上堆积贮藏，翌春播种。
根茎繁殖的于秋季收获射干时，选择生长健壮、无病虫害的根茎作种根栽植。