Nano Letters:DNA长度决定着细胞内SWCNTs的“命运

发布时间:2024-03-17
单壁碳纳米管(swcnts)因在近红外(nir)区域有稳定的光致发光特性而在生物成像领域应用颇多。单链dna可以通过非共价键与swcnts结合(dna-swcnts),使swcnts有更好的生物相容性。研究表明,swcnts进入人体之后,会被巨噬细胞“内化”,并在溶酶体定位。对swcnts的表面进行修饰,可以改变swcnts在细胞内的“命运”。但是,人们对dna单链的长度如何影响dna-swcnts在复杂细胞环境中的代谢知之甚少。
2019年3月,美国罗德岛大学daniel roxbury教授课题组在《nano letters》发表题为“biomolecular functionalization of a nanomaterial to control stability and retention within live cells”的文章,介绍了dna-swcnts与细胞之间相互作用的关系。
dna单链的长度与dna-swcnts荧光强度的关系
为了研究dna单链的长度对dna-swcnts光学特性的影响,作者先用五种单链dna((gt)n,n=6,9,12,15,30)对swcnts进行修饰,后与小鼠巨噬细胞一起培养30分钟((gt)n-swcnts浓度:1mg/l)。当用730 nm激光激发时,大多数细胞表现出明亮的宽频发射(900-1600nm),说明dna-cnts被细胞“内化”。作者探究了荧光强度与dna单链的长度和时间的关系,结果显示,dna-swcnts荧光强度与dna单链长度成正比而与时间成反比。有趣的是,具有较长dna单链的dna-swcnts的初始的荧光强度分布较广,说明长链dna使dna-swcnts对近红外光更敏感。作者对细胞内dna-swcnts的荧光强度进行了量化并计算了细胞内的平均荧光强度,发现细胞内的荧光强度随着dna链长的增加而增加,皮尔森相关系数分别为0.846、0.885和0.850,证实两者线性相关且具有统计学意义(图1)
图1:dna-swcnts的荧光强度与dna单链长度的关系;(a)(gt)15-swcnts的荧光图像、白光图像和整合的荧光/白光图像;(b)dna-swcnts的荧光图像;(c)dna-swcnts荧光强度柱形图;(d)dna-swcnts的平均荧光强度
dna-swcnts荧光强度与dna单链长度和swcnts手性的关系
为了进一步比较swcnts手性与荧光稳定性的关系,作者将发射中心波长转化为能量,并将dna-cnts的荧光强度与对照组做了对比。研究表明,5种dna-swcnts中,只有(gt)6-swcnts荧光强度随时间的延长而增加,其他4种dna-swcnts的荧光强度有适度的损失。对于某一种手性的swcnts而言,(gt)n-swcnts荧光强度损失没有在同一时间段内发生,说明荧光强度的损失是多种因素的结果。为了在单细胞水平上研究光谱位移,作者利用高光谱技术绘制了(gt)6-swcnts和(gt)30-swcnts的高光谱图像,并将高光谱图像中每一个包含swcnts像素点拟合到洛伦兹曲线上,用(94)-swcnts的中心辐射能量图覆盖白光图,并为每个图像构建直方图以描述细胞内swcnts发射能量的变化。作者发现,0h的时候,(gt)6-swcnts和(gt)30-swcnts的荧光强度在统计意义上*相同。将直方图进行高斯拟合,可以通过半全宽来评估总体的异质性。研究表明,内化后(gt)6-swcnts的半高宽是(gt)30-swcnts的两倍,且(gt)30-swcnts的辐射强度不随时间变化。6 h后,(gt)6-swcnts的发射能量降低了8 mev,半高宽降低了50%。作者认为,这种近红外光荧光强度的变化是dna-swcnts复合物的dna单链末端相对丰度变化的结果,对于dna-swcnts中一定质量的dna,(gt)6-swcnts中dna单链数是(gt)30-swcnts的5倍(图2)。
图2:荧光强度与dna单链的长度和swcnts手性的关系;(a)细胞内荧光强度的热图;(b)(gt)6-swcnts和(c)(gt)30-swcnts的白光图和高光谱图像的叠加图和荧光能量分布直方图
细胞内dna-swcnts荧光强度的稳定性
被细胞内化的dna-swcnts的光谱稳定性有较大差异。作者基于swcnts对常规有机荧光团的淬灭效应,设计了一种检验dna-cnts完整性的方法。实验人员首先用cy3对(gt)6-swcnts和(gt)30-swcnts进行标记,脱氧胆酸钠(sdc)小分子通过竞争机制取代cy3-dna附着在swcnts的表面,使原来发生荧光淬灭效应的swcnts重新发出明亮的荧光。尽管sdc的置换动力学不相同,但cy3-(gt)6-swcnts和cy3-(gt)30-swcnts的荧光淬灭动力学是相似的。当用含有cy3-(gt)6-swcnts和cy3-(gt)30-swcnts的细胞培养物培养巨噬细胞时,cy3-(gt)6-swcnts和cy3-(gt)30-swcnts的荧光淬灭现象有很大的不同,cy3-(gt)6-swcnts很快的发生荧光淬灭并在4 h达到maximum荧光强度,24h后降至初始荧光强度;相比之下,cy3-(gt)6-swcnts则在任何时间段均未观察到荧光淬灭现象(图3)。
图3:dna-swcnts在细胞内的稳定性;(a)实验设计示意图:swctns被dna单链紧密包裹时,未发生荧光淬灭现象,dna单链解离时发出强烈荧光;(b)荧光强度随sdc小分子置换时间的增加而增加;(c)用cy3-(gt)6-swcnts和cy3-(gt)30-swcnts培养的raw 264.7细胞的白光图和荧光图的叠加;(d)平均荧光强度直方图
细胞对dna-swcnts的“内化”和“外排”
尽管swcnts的荧光强度受到浓度和局部环境的影响,但是swcnts的某些特征只和浓度有关,这就意味着,无论样本的荧光强度如何,swcnts的手性信息在拉曼图谱中都可以被表达出来。作者使用共聚焦拉曼显微镜评估了swcnts在细胞内的局部浓度,首先使用1mg/l的cy3-(gt)6-swcnts或cy3-(gt)30-swcnts培养巨噬细胞30分钟,对0.5μm的微小区域进行拉曼成像。为了计算出每个细胞内swcnts的质量,作者得出了g峰与swcnts浓度的特征曲线。cy3-(gt)6-swcnts培养的巨噬细胞中swcnts的起始浓度是cy3-(gt)30-swcnts培养的巨噬细胞的两倍;24 h后,cy3-(gt)6-swcnts培育的巨噬细胞内swcnts的浓度下降了75%,而cy3-(gt)30-swcnts培育的巨噬细胞内swcnts的浓度下降较小。作者将cy3-(gt)6-swcnts培育的巨噬细胞内swcnts的起始浓度高的原因归结于单根swcnts上的dna密度较大,这增加了细胞膜蛋白与dna相互接触的概率;相反,也正是由于膜蛋白与dna接触概率的增大,从而使得巨噬细胞可以更快的以胞吐的形式“释放”swcnts。
为了更好的理解胞吐机制,作者对细胞“释放”(gt)6-swcnts的途径进行了探究。作者设计了一个实验,用巴弗洛霉素a1和诺考达唑(两种抑制细胞溶酶体胞吐作用的化学药物)对巨噬细胞进行了处理,并比较细胞内dna-swcnts的浓度。结果显示,(gt)6-swcnts在细胞内的浓度高于对照组,(gt)30-swcnts的浓度与对照组相比变化不大;相反,用布雷非德菌素a和exo1(两种抑制高尔基体分泌的化学药物)对巨噬细胞进行处理,结果显示,(gt)6-swcnts和(gt)30-swcnts的浓度与对照组相比差异性较小;这说明细胞主要是通过溶酶体的胞吐作用来实现dna-cnts的“释放”(图4和图5)。
图4:通过共聚焦显微镜确定swcnts的浓度;(a)cy3-(gt)6-swcnts和cy3-(gt)30-swcnts培养的raw 264.7细胞的g峰强度图和白光图(b)从细胞中roi区域像素点计算得出的swcnts的浓度;(c)被细胞内化的swcnts的比值;(d)细胞上清液中外源性swcnts的浓度;(e)共聚焦拉曼光谱g峰强度图与白光图的叠加;(f)在(e)图中包含swcnts的所有像素点的平均浓度
溶酶体胞吐的主要功能之一是分泌各种生物大分子,如蛋白质、酶和抗原,以进行细胞之间的信息传递,也可使周围细胞产生免疫反应。有研究表明,对swcnts的表面进行修饰可以有效降低对细胞的毒性,原始的swcnts与细胞膜上的受体相互作用之后会被认为是一个有害物质。因此,作者认为溶酶体将dna链段从dna-swcnts复合物上去除后,会使得细胞将“裸露”的swcnts当做异物,而引发细胞的胞吐作用将其排出,导致细胞内swcnts的浓度降低;而长链的dna对swcnts的包覆比较严密,溶酶体无法将dna-swcnts复合物上的dna“剔除”,从而无法产生胞吐作用,这会导致(gt)30-swcnts在细胞内的滞留。
图5:dna长度相关性的细胞内加工示意图;(a)巨噬细胞将(gt)6-swcnts复合物内化并在溶酶体内定位,随后生物分子与dna链发生交换,并迅速诱导溶酶体胞吐;(b)巨噬细胞将(gt)30-swcnts复合物内化并在溶酶体内定位,而dna-swcnts的完整性使swcnts被长时间保留在细胞内
总结:
作者借助于可见-近红外高光谱成像和共聚焦拉曼显微技术,发现dna单链的长度对dna-swcnts的光学稳定性有影响,通过调节dna单链的长度可以实现对细胞“摄入”和“外排”swcnts的调节;dna-cnts上较短的dna单链在溶酶体内被细胞的生物小分子取代,改变了swcnts的物理特性和在细胞内的“命运”;最后通过药物实验证实了细胞对swcnts的“外排”是通过胞吐作用。这些发现有助于人们进一步理解swcnts与细胞之间的相互作用,也为后续科研人员进一步探究细胞对官能化小分子的“响应性”奠定了理论基础。
参考文献
[1] gravely m, safaee m m, roxbury d.biomolecular functionalization of a nanomaterial to control stability andretention within live cells[j]. nano letters, 2019, 19(9) 6203-6212.
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