1、立枯(苗腐)病
此病危害症状为：苗期茎基部发生黄色水渍状，进而幼茎缩细而枯萎倒伏。可采用彻底排水，适当保持干燥，撒多菌灵、托布津消毒等方法进行防治。
2、叶枯病
危害叶片，开始产生白色小点，以后逐渐扩大成褐色病斑，造成叶片枯萎，防治时可以将种子用甲氧乙氯汞消毒，温室经常通风，发病前后喷托布津、多菌灵、代森锌等。
3、虫害
在金鱼草的幼苗期，应防范蟋蟀及蝼蛄的危害，可在清晨勤察看，发现后即除之；还可用50％辛硫磷乳油1500倍液防治。蚜虫为害较为普遍，用40％乐果乳油或50％马拉硫磷1000～1500倍液进行防治。