这类植物的根系充分体现出对环境的适应性。在原产地，除了极少数地区外，年降水量一般不低于200毫米，但降水量分布极不均匀，土壤持水力又很差，因此大多数种类的根系分布得很广，但向下延伸不深，一般在5～10厘米的表土层内，有利于最大范围地吸收雨水与露水。根一般都是须根，有些仙人掌属的种类有近似木质化的主根。少数种类地上部分很小，但根部肥大成为贮水的主要器官。番杏科生石花属种类，株形小，根细，但根颈处一段直根，外有木栓层保护，一可避免接触表层砾石传热灼伤根部；二可避免散失水分。
这些根的渗透压一般都很低，浇灌的水不能含过多的盐类；施肥时浓度绝对不能过高。