切花百合二茬花栽培管理方面有一定的特殊性，要特别注意。
1、土壤选择与处理
在盐碱地栽培要采用大水漫灌进行土壤洗盐，以防止二茬花缺铁黄化等生理病害的发生，百合喜肥，但忌碱性和含氯、含氟的肥料，否则容易引起百合叶片叶烧等生理病害。追肥可使用尿素、硫酸铵等酸性肥料，忌使用复合肥或磷酸二铵等肥料。
2、中耕除草
百合头茬花采收后，要及时进行田间松土除草，防止土壤过于板结而影响花后种球发芽。在种球已经通过低温处理开始发芽的后期，中耕除草时，不能碰断或碰伤新鳞茎的芽体。
3、病虫害防治
头茬花采收后，要及时对头茬花剪后留下的茎秆进行杀菌剂喷雾，预防病虫害的发生，尽量延长功能叶的绿叶期。适宜的药剂有甲基托布津、多菌灵等。
4、温室通风
头茬花90％以上剪切上市后，要对日光温室进行大面积通风降温。可以揭开底脚的薄膜，加大对流，以降低室温至2℃至5℃，这样做有利于种球打破休眠。
5、土壤水分
百合生长期喜湿润，尤其是头茬花后要有较高的湿度，以利于降低土壤温度，促进花后新鳞茎的发芽。
6、温度调控
切花百合二茬花生产的温度调控，3个时期较为关键。第一个时期为种植后的20天至30天，要求温度维持在12℃至15℃；第二个时期为现蕾后至剪切前，要提高室温至20℃至25℃，如果低于5℃或高于30℃都会引起百合裂苞；第三个时期为头茬花后低温处理阶段，白天最高温度控制在15℃至18℃，最低温度应在0℃以上。