花卉依植物分类系统的分类，即按门、纲、目、科、属、种等主要分类单位，依一定的 阶层系统排列进行分类。通常将花卉分成蕨类植物、裸子植物、双子叶植物和单子叶 植物4大类，然后每类按科分属、按属分种、按种分品种。此种分类方法的优点之一是简便易行，查找方便。每种花卉按照它们在植物分类 系统中的地位进行排列，只在一处出现，不会有交叉重复或难于归类的问题。优点之 二是它能明了彼此亲缘关系的远近，在栽培管理、遗传育种工作中都有实际意义。
但此种分类方法也存在着明显的缺点。缺点之一是专业性太强，难于掌握。若不 清楚某种花丼的分类地位与学名，就难以找到此种花卉。缺点之二是此种分类有时与 生产实践不一致，如现有的多浆花卉来自40个不同的科，但在形态、生理和生态上极 其相似，栽培方法也基本一致。