杂交亲本的选配关系到杂交育种的成败和育种水平。一般原则是：
①亲本性状能相互取长补短，而且优良性状要突出;
②亲本对当地环境条件的适应性，尤其是选作母本的材料要有较强的适应能力;
③双亲的开花期要比较一致，母本的结实能力要比较强;
④育种目标要求的主要性状，至少应有一个亲本中表现突出，而且遗传力较大;
⑤亲本的亲缘关系和生态型，一般亲缘关系远或生态型差异大的亲本杂交，其后代的遗传基础更为丰富，出现超亲本的机率更大。
在茶树杂交育种中，主要采用简单杂交与回交两种方法。杂交后代的选择，主要采用单株选择法，应从苗期开始。
苗期选择是根据某些相关性状来进行的。凡发根性能良好，茶苗高度适中，分枝与叶量较多，叶片大小中等，营养生长期长，腋芽萌发力强以及抗逆笥强的杂种后代，往往有较大希望育成高产稳产良种。
对入选的优良单株或类型，要及时进行扦插繁殖，布置品系比较试验。