农药一般可分为杀鼠剂、杀虫剂、杀菌剂、除草剂、植物生长调节剂及杀螨剂等，其是当代农业生产中*的重要生产资料。近十年来新型高效农药的不断出现使农药的环境影响及残留农药的检测方法也发生了新的变化。比如超高效磺酰脲类除草剂在每亩地里只需施洒一至二克就要求土中磺酰脲的液相色谱仪检测限必须达到pg级。很多新型农药的水溶性较好长期积累就会造成了意想不到的地下水污染，饮用水中低水平化学品对人体内分泌系统的影响也已经引起了科学家的重视。
因此发展高灵敏度的多残留物可靠分析的方法已成为环境分析化学和农业化学家的重要目标。高效液相色谱仪弥补了气相色谱的缺陷，可以直接测定那些难以用气相色谱分析的农药。但是常规检测器如紫外和二极管阵列不可能对不同类型的农药有较相似的响应，复杂环境样品在痕量分析时的化学干扰也常影响痕量测定时的定量精度，因而其在多残留超痕量分析时具有局限性。当大气压电离质谱成功地与高效液相色谱联用后，专家们敏感地认识到其将成为农药分析的重要技术并将推动痕量有机毒物的环境行为的研究。