1、rfid编码标准的选择。目前世界范围内还没有形成统一的有关电子标签(rfid)的标准。在我国的标准制定方面，国家标准委已经联合科技部、信息产业部以及上海标准化研究院等14家单位共同进行中国rfid标准的研究，目前已完成对动物应用rfid标准的草案，并由上海市推出了《动物电子标示通用技术规范》，但该规范还只是初步形成，尚在不断改进中，而且要想短时期内在全国范围内推广还有一定难度。而除畜牧业以外的其他种类农产品的rfid标准仍有待研究。
2、rfid的信息安全问题。rfid的数据安全性问题也是一个引人注目的话题。由于电子标签中保存了一些数据，因此隐私保护成了一个非常重大的问题，甚至是影响商业应用前途的关键点。由于电子标签数据的读取是由阅读器发射无线射频触发的，也就是说，只要阅读器的发射频率相同，应答器即标签就会做出相同的反应，传输相同的数据，这就会给不法分子造成可乘之机。
为了解决以上问题，就必须对id的读取进行限制。目前最成功的就是采用加密的方式，在电子标签中嵌入加密就可以将实时监控数据写入数据库中。如果有的系统参数工作处于非正常状态，则必须在界面中给出警告信息，并对监控系统进行调控。为了使用户便于观察和直观的理解，需要将采集到的数据转换成一种直观的、易于为用户接受的形式显示出来，即将数据以图表的形式表示出来。vc中的gui可以很方便地支持实现以图表形式表示。