防治西瓜烧根要注意配制营养土时使用的有机肥必须经过腐熟;营养土中尽量不用或少用化肥;出现烧根的，应视苗情、墒情和天气情况，适当增加浇水量和浇水次数，以降低土壤溶液浓度。
西瓜沤根表现为根部发锈，严重时根系表皮腐烂，不长新根，幼苗易枯萎。属于生理性病害，主要是由于床土温度过低，湿度过大引起。
防治西瓜沤根，首先，要改善育苗条件，保持合适的温度，加强通风换气，控制浇水量，调节湿度，特别是连阴天不要浇水。一旦发生沤根，及时通风排湿，增加蒸发量，勤中耕松土，增加通透性;如土壤过湿，可撒些细干土或煤灰吸水，使床土温度尽快升高。采用多层覆盖以利于保温和地温升高，在温度较低或连阴、雨、雪天进行临时加温。
西瓜烧根时根尖发黄，不长新根，但不烂根，地上部分生长缓慢，矮小脆硬，不发棵，叶片小而皱，易形成小老苗。原因：有机肥未充分腐熟，或与床土未充分过筛拌匀;营养土中过量施用化肥，土壤溶液浓度过大;土壤干燥，土温过高。
防治西瓜烧根要注意配制营养土时使用的有机肥必须经过腐熟;营养土中尽量不用或少用化肥;出现烧根的，应视苗情、墒情和天气情况，适当增加浇水量和浇水次数，以降低土壤溶液浓度。