1、中和（neutralization）。这是抗体最基本的功能。抗体的中和指的是抗体和抗原结合后，抗原失去原有的功能。比如病毒的糖蛋白无法和细胞受体结合，酶无法进行催化，转运蛋白无法转运等等。中和是抗体自身的功能，仅由抗体的分子结构决定，不需要免疫系统的其它部分参与。
2、凝集（agglutination）。抗原和抗体结合后会凝集成一团，失去行动力，有利于免疫系统的清除。
3、调理（opsonization）。抗体和抗原结合会促进吞噬细胞对抗原的吞噬。由于细胞膜带负电会互相排斥，被抗体覆盖的细菌或细胞更易于被吞噬。
4、激活补体。抗体和抗原结合会触发补体反应。补体（complement）是人血液中广泛存在的蛋白。补体被抗体激活后可以辅助调理，以及在生物膜上穿孔，破坏膜结构。
5、adcc。抗体和细胞表面的抗原结合可以促进自然杀伤细胞对细胞的杀伤。自然杀伤细胞和t细胞都可以杀死细胞，但t细胞是通过细胞的mhc i受体呈递的抗原识别异常细胞，而自然杀伤细胞是通过抗体和细胞表面抗原的结合识别异常细胞。
总的来说抗体的作用可以分为两类，一个是抗体的中和作用，这是抗体自身的，不依赖免疫系统其它部分。一个是抗体的标记作用，通过和抗原结合标记抗原，让免疫系统的其它部分来摧毁。这两个是互相独立的。有的抗体没有中和作用，它们和抗原结合并不能让抗原失效，但仍然可以触发免疫系统的杀伤。又比如狂犬免疫球蛋白是一种马抗体，马抗体和人抗体结构不同，无法配合人的免疫系统。但马抗体仍然可以中和狂犬病毒，因为中和是抗体本身的分子结构决定的，不依赖免疫系统。