通过海关进行知识产权保护主要依靠主动保护和被动保护两种模式。其中主动保护模式有知识产权备案，海关发现侵权嫌疑货物后通知权利人，知识产权权利人提出扣留侵权嫌疑货物的申请等。知识产权海关保护执法程序为当事人发现侵权嫌疑货物即将进出口，向海关提出扣留申请，并提供担保等。
一、怎样通过海关进行知识产权保护
通过海关进行知识产权保护依靠主动保护和被动保护两种模式：
1.主动保护模式有以下内容：
(1)知识产权备案;
(2)海关发现侵权嫌疑货物后通知权利人;
(3)知识产权权利人提出扣留侵权嫌疑货物的申请;
(4)海关对货物的侵权状况等进行调查认定;
(5)海关没收侵权货物或者协助人民法院对货物进行司法扣押;
(6)对没收的侵权货物进行处置;
2.被动保护模式下有以下内容：
(1)知识产权权利人发现侵权嫌疑货物后向海关申请扣留;
(2)海关扣留侵权嫌疑货物;
(3)海关在扣留20个工作日内协助人民法院对货物进行司法扣押或者放行货物。
二、知识产权海关保护执法程序
知识产权海关保护执法程序如下：
1.当事人发现侵权嫌疑货物即将进出口，向海关提出扣留申请，并提供担保；
2.由海关依法受理，并扣留货物，书面通知权利人。
法律依据：
《中华人民共和国知识产权海关保护条例》第十二条
知识产权权利人发现侵权嫌疑货物即将进出口的，可以向货物进出境地海关提出扣留侵权嫌疑货物的申请。
第十五条
知识产权权利人申请扣留侵权嫌疑货物，符合本条例第十三条的规定，并依照本条例第十四条的规定提供担保的，海关应当扣留侵权嫌疑货物，书面通知知识产权权利人，并将海关扣留凭单送达收货人或者发货人。
三、知识产权海关保护的概念
知识产权海关保护是指海关为禁止侵犯知识产权的货物进出口，对与进出口货物有关并受中华人民共和国法律、行政法规保护的商标专用权、著作权和与著作权有关的权利、专利权依照国家有关规定实施的保护。知识产权权利人也可主动请求海关实施知识产权保护，但应事先向海关提出采取保护措施的申请。