1.内置反应堆的建造。11月至来年3月建造。具体操作如下：
①混合料。一般在填加秸秆前2天进行。每1/15公顷（1亩）用菌种6千克，疫苗3千克，将菌种、疫苗、中间料（以麦麸为中间料，三者比例为1∶30∶26；以玉米芯粉为中间料，三者比例为1∶100∶140）和水充分拌匀，即为混合料。将其摊放在室内，厚度10～15厘米，第2天即可使用。
3.反应堆加水。一般内置反应堆20天左右浇1次水，外置反应堆10天左右加1次水，用水量以湿透秸秆为准。外置反应堆秸秆转化消耗1/2时，需填料加接菌种。栽培1季需填加2～3次秸秆。
4.秸秆生物反应堆浸出液的利用。秸秆转化后的浸出液营养齐全、含有大量的二氧化碳、抗病虫害，用它浇根和喷施叶面有增产、生根、防病虫等作用。一般果树一个生长季节灌根2次，开花前期和果实膨大期进行，每株用5千克，结合浇水进行。叶面喷施时先过滤，再按3份浸出液对1份水混合喷施，每5天喷1次，喷施主要部位是叶背面。
为了来年结果多、产量高、早熟，在果实收获后继续加强内外置反应堆的应用。