一. 一般土壤处理
土壤应不含病原体。可进行以下处理：（1）换新土或在野外轮作。（2）加强管理，保证良好的生长条件。如需进行土壤处理，应一年处理一次，主要采用蒸气消毒、浸泡或使用化学方法对土壤消毒。具体采用哪种方法要视温度、使用持续时间和浓度而定。
1.蒸气消毒
对25至30厘米深的土壤用80℃的蒸气消毒至少1小时，弱压蒸气效果好于强压蒸气。蒸气消毒可防治腐霉病以外的其他病害，如果能再辅以施加特殊的杀菌剂除菌效果会更好。但对ph较低的淤泥土，蒸气会导致其中有害物质mn超标，只有加入适量石灰调节ph值或短期蒸气才能使mn含量控制在标准值范围内。
2. 浸泡
在温室中常采用此方法消毒土壤。第一步，在五月播种两色蜀黍等作物。第二步，大约六月中旬，当植物约50厘米高时，将土层深耕至20厘米处，随后每1000平方米土壤施入100公斤硝酸钙。第三步，七月底，作成宽60至70厘米的畦，灌水并覆盖薄膜。2至3周后，用旋耕机处理土壤并检查其ph值和电解质浓度。
3. 化学方法
如果条件允许，可使用杀菌剂和化学药剂来消毒土壤。采用这种方法，应在土壤温度不低于10℃时进行，随后覆盖薄膜。温暖的天气3天后，（冷凉的天气7至10天）将薄膜去除。
二, 土壤处理的其他方法
腐霉菌再生能力很强，因此一年进行一次普通土壤处理是不够的。为控制真菌的生长，每次种植前还要使用杀菌剂进行防侵染处理。为处理均匀，应将可湿性粉剂与沙子混合，然后用手撒播，或加温水用粗嘴喷壶喷射，其作用效果可至土表下15至20厘米处。此外，人工或使用旋耕机将杀菌剂与土壤混合均匀非常必要。
球根处理
在鸢尾切花生产中，必须于种植前将球根在杀菌剂中浸蘸一下，不同浓度的杀菌剂处理方法不同，见下表：
处理方法时间浓度
长期浸泡15分钟 1倍
短期浸泡1分钟 1.5倍
短期浸泡15至30秒 2倍
淋洗15分钟1.5倍
淋洗 5分钟 2倍
特别强调，应重视真菌等病害。杀菌剂处理球根还应配以良好的栽培管理措施。