蚜虫是温室南方红豆杉扦插苗的主要害虫之一，由于温室内的常年温度保持在18℃以上，在冬季，蚜虫不存在越冬问题，在夏季，如果外界温度不特别高(≯38℃)，温室内的扦插苗又有一定的叶面积，蚜虫仍能继续繁殖、危害。温室南方红豆杉病虫害发生危害特点与露地南方红豆杉种苗也有着显著的不同，因此，欲控制温室内南方红豆杉病虫害就需要应用新的防治策略和防治技术。为了有效地防治红豆杉病虫害，从红豆杉扦插育苗开始，对其整个生育期的主要病虫害发生种类与特点进行监测、调查、研究、实践，采取生态防治、物理防治、栽培防治、消毒，以及化学防治等综合技术，建立了温室南方红豆杉扦插苗病虫害综合防治技术体系，现已取得明显的防治效果。
温室南方红豆杉扦插苗在整个生长期内的病虫害共有7种，即立枯病、茎腐病、白绢病、疫霉病、叶螨、蚜虫、介壳虫等。其中，除了茎腐病、白绢病最为严重外，还有蚜虫的危害最重。
蚜虫是温室南方红豆杉扦插苗的主要害虫之一，由于温室内的常年温度保持在18℃以上，在冬季，蚜虫不存在越冬问题，在夏季，如果外界温度不特别高(≯38℃)，温室内的扦插苗又有一定的叶面积，蚜虫仍能继续繁殖、危害，因此，蚜虫在温室中发生的特点是以孤雌生殖的方式，在温室中周年发生繁殖，并且世代重叠。
采用10%%吡虫啉乳剂施洒苗床可有效地防治扦插苗的蚜虫，防治效果达95%%以上。