一般来说，长期在北方栽培的品种比长期在南方栽培的品种抗寒，成年树比幼树和幼苗抗寒。所以在有冻害的地区，应加强苗期防冻措施，尤其在移栽时，由于根系受伤后缩小，容易受冻害，更应备加注意。在这些地区进行嫁接时，选坐地苗做砧木比较有利。
从生育时期来看，银杏在休眠期耐寒力较强，温度降至-18℃--20℃时，不会发生冻害，甚至可耐-38℃的短期低温。但是，如果低温持续时间过长，则会受冻害，甚至被冻死。银杏在休眠期的耐寒力，随着休眠深度的加大而增加。银杏萌动以后，其抗寒力随着萌发程度的加大而减弱，特别是温度骤然降低时受害最大。
例如天津蓟县，1997年2月下旬气温上升很快。2月22日以后，当地日最高气温大于16.7℃，银杏已经萌动。但在3月4日寒流来临时，气温突然下降到6•6℃，温度相差23•3℃，致使一年生枝条的顶芽被冻死。又如19 67年，陕西关中在3月4日以前，日平均气温升到8℃～9℃，银杏树芽已经萌发，但在3月4日至6日，当地忽降大雪，日平均气温骤然降到-0.4℃--0.5℃，已萌发的银杏芽全部被冻死。由此可见，已萌发的银杏枝芽不耐- 2℃的低温。
土壤的温度也能较大地影响银杏的生长发育。土层10厘米深处的温度达到6℃以上时，根系开始活动。土层25厘米处的温度达到12℃左右时，其新根大量形成。新根生长的最适宜土壤温度为15℃～18℃。在适宜的土壤温度下，银杏根系吸收养分的能力最强。温度达到23℃以上时，根系活动受抑制，温度超过其最大允许值后，其吸收养分的能力就会降低，对于土壤的高温，可以用喷水或灌溉的方法进行临时调整。