一、合同协议纠纷找哪个部门
合同协议纠纷找人民调解委员会、仲裁委员会、人民法院调解。
根据《民事诉讼法》第九十三条规定，人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。
《仲裁法》第五十一条规定，仲裁庭在作出裁决前，可以先行调解。当事人自愿调解的，仲裁庭应当调解。调解不成的，应当及时作出裁决。
调解达成协议的，仲裁庭应当制作调解书或者根据协议的结果制作裁决书。调解书与裁决书具有同等法律效力。
二、合同纠纷诉讼时效
合同纠纷的诉讼有效期为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。
《民法典》第五百九十四条
因国际货物买卖合同和技术进出口合同争议提起诉讼或者申请仲裁的时效期间为四年。
三、合同纠纷怎么起诉
1.撰写起诉状、准备证据材料；
2.到有管辖权的人民法院提起诉讼，提交起诉状和证据材料；
3.法院认为符合起诉条件的，在七日内立案并通知当事人。
根据《民事诉讼法》第一百二十条第一款的规定，起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
第一百二十三条规定，人民法院应当保障当事人依照法律规定享有的起诉权利。对符合本法第一百一十九条的起诉，必须受理。符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。