随着所气温不断升高，水温也会上升，微生物繁殖加快，溶解氧降低，水质劣化。不恰当地添加营养液，使溶解浓度过高，都可能造成水培花卉根系腐烂，尤以百合科的朱蕉，马尾铁（细叶千年木）、五色千年木为重。
对烂根的花卉采用以下方法能使其恢复长势：
① 把腐烂的根系全部清除，茎部已受侵染也要用利刀切除被侵染部分。
② 修剪过的花卉浸入0.5%高锰酸钾溶液浸泡10～20分钟灭菌。
③ 取出浸泡的花卉，在流动水中冲洗。
④ 清洗后的花卉放入原器皿用清水栽养（器皿应洗净）。
⑤1～2天换一次水，只换清水不加营养液。水质清澈，可以减少换水次数。养护10～15天能有新根萌生。
⑥ 初萌新根仍以清水栽养，待气温稳定在18～25℃，用营养液栽培。