绿色食品标志使用期是三年，是获得证书的当天开始起算，如果不符合规定的，会取消该产品的使用标志。绿色食品标志申请流程是需要申请人填写申请书、提交相关材料到绿色食品管理部门，等待审核、审核成功即可公告于众。
一、绿色食品标志使用期是几年
绿色食品标志使用期是3年。绿色食品标志是由绿色食品发展中心在国家工商行政管理总局商标局正式注册的质量证明标志，其商标专用权受《中华人民共和国商标法》保护。 通过绿色食品认证的产品可以使用统一格式的绿色食品标志，有效期为3年，时间从通过认证获得证书当日算起，期满后，生产企业必须重新提出认证申请，获得通过才可以继续使用该标志，同时更改标志上的编号。 从重新申请到获得认证为半年，这半年中，允许生产企业继续使用绿色食品标志。如果重新申请没能通过认证，企业必须立即停止使用标志。另外，在3年有效期内，中国绿色食品发展中心每年还要对产品按照绿色食品的环境、生产及质量标准进行检查，如不符合规定，中心会取消该产品使用标志。
二、绿色食品标志申请流程
1.申请人填写《绿色食品标志使用申请书》，一式两份(含附报材料)，报所在省(自治区、直辖市、计划单列市)绿色食品管理部门。
2.省绿色食品管理部门委托通过省级以上计量认证的环境保护监测机构，对该项产品或产品原料的产地进行环境评价。
3.省绿色食品管理部门对申请材料进行初审，并将初审合格的材料报中国绿色食品发展中心。
4.中国绿色食品发展中心会同权威的环境保护机构，对上述材料进行审核。
5.中国绿色食品发展中心对质量和卫生检测合格的产品进行综合审查(含实地核查)，并与符合条件的申请人签订“绿色食品标志使用协议”。由农业部颁发绿色食品标志使用证书及编号；报国家工商行政管理局商标局备案，同时公告于众。
三、绿色食品标志的含义是什么
绿色食品标志的含义是由绿色食品发展中心在国家工商行政管理总局商标局正式注册的质量证明标志。它由三部分构成，即上方的太阳、下方的叶片和中心的蓓蕾，象征自然生态；颜色为绿色，象征着生命，农业、环保；图形为正圆形，意为保护。aa级绿色食品标志与字体为绿色，底色为白色，a级绿色食品标志与字体为白色，底色为绿色。