采用issr分子标记对金花茶的4个自然分布居群的126份样品的遗传多样性水平进行了研究。用12条引物，共检测到105个清晰的扩增位点，其中多态性位点79个，多态位点百分率(ppb)为75．24％。采用popgene软件进行分析，结果表明：居群总的nei’s基因多样性指数为0．2302，shannon信息多态性指数为0．3502，金花茶总的遗传多样性水平较高。但金花茶居群内的遗传多样性相对较低。基因分化系数为0．5752，遗传变异主要存在于居群间。用ntsys软件对样品进行upgma聚类分析，结果4个居群的样品各自聚在一起，而金花茶两间断分布区区内的居群又各自聚在一起。金花茶4个居群间的遗传距离与地理距离呈显著的正相关(r=0．68261，p=1．0000)。完成机构：[1]广西师范大学生命科学学院，桂林541004 [2]防城金花茶自然保护区管理处，广西防城538021 [3]扶绥凤凰山林场，广西扶绥532114