兰屿肉桂的嫩叶及新芽上易发生蚜虫刺吸危害，导致叶片沾满油腻，并继之诱发煤污病，影响到植株的生长和陈列观赏。防治方法：植株上撒布草木灰后，用净水冲刷干净；喷洒苦楝树叶汁液，可有效杀虫；用10％的吡虫啉可湿性粉剂2000倍液喷杀。
多发生于夏秋间，它将数枚新叶卷缩成巢，幼虫潜在其中取食叶片，可用90％的敌百虫晶体800倍液，或40％的乐果乳油1000倍液，进行喷杀。
病树叶片逐渐变黄下垂，严峻时变褐干枯，茎干失水干缩，根系变褐腐烂，病株短期内死亡。病根、病土及遗留的带病残株是该病的初侵染源，由风雨或接触传染，一般为单株发生。防治方法：重病株及因病枯死的植株，要连根拔除并烧毁，并用50％的多菌灵可湿性粉剂600倍液消毒；发病初期，喷洒50％的甲基硫菌灵?硫磺悬浮剂800倍液，或50％的根腐灵可湿性粉剂800倍液，进行防治。
4月至5月间发生于植株新叶上，开始叶面发生卵形黄褐色病斑，以后不断扩大，并在叶片正面病斑内泛起较多的玄色小点粒，病斑背面呈紫色，以致全叶黄化而凋萎，使植株大量落叶。防治方法：可用1％的波尔多液，进行预防；泛起少量病叶，及时摘除烧毁；发病初期用50％的多菌灵可湿性粉剂500倍液，或50％的苯菌灵可湿性粉剂1000倍液，或50％的杀菌王水剂1000倍液，每隔10天交替喷洒一次，连续3次至4次。
主要危害苗期及成株叶片。叶片染病，多发生在叶面、叶尖、叶缘处，呈褐色，外形不规则，后期常扩展或融合成灰褐色大斑，边沿棕褐色，波浪状，病斑上生有很多玄色小粒点，即为其分生孢子盘。分生孢子借风雨传播，湿度大时孢子萌发侵入叶片或幼苗进行危害，在连续阴雨、阳光不足、泥土黏重或棚室内湿气滞留时易发病，2月至4月最为流行。防治方法：发现少量病叶，及时摘除销毁；生长季节增施磷钾肥，进步植株抗性；发病初期，用25％的炭粉灵可湿性粉剂500倍液，或60％的炭必灵可湿性粉剂700倍液，或75％的甲基托布津可湿性粉剂600倍液，交替喷洒，每隔10天至15天一次，连续3次至4次。