1、外形差异
小叶种叶片小而脆硬，叶面的革质层较厚。大叶种角质层厚度为2-4μm，叶大柔软，且叶面的革质层则比较薄；中小叶种角质层厚度4-8μm。(注：μm=微米，1毫米=1000微米)
2、结构差异
大叶种细胞内叶绿体较多，有60-100片层，光台速率较高，细胞组织比较多而松，叶背的气孔大而细，叶色多带黄绿，叶尖较锐长，梗和节间长，单位叶片面积的气孔数较少，气孔的保卫细胞较大，蒸腾速率快。
小叶种细胞内叶绿体较少，有20-40片层，光合速率较低，叶背气孔多而密，叶色多浓绿，叶尖较钝。
3、芽叶重差异
从全国红绿茶产区的高产实例看，大叶种芽叶重在0.4-0.5g，每0.11m采面上芽叶数应有200-250个；中小叶种芽叶重在0.2-0.25g，每0.11m采面上芽叶数要有400-500个。芽叶平均重量，取决于茶树的种性，如云南大叶种在正常培育下，一般4da-500个1芽2-3叶混合芽就有500g；而中叶类型的苔茶品种则要2000个才达500g，小叶类型的要3000个以上才达500g。
4、耐泡性差异
相比之下大叶种的海绵组织细胞较小，大叶种比小叶种茶更经久耐泡；大叶种与小叶种的化学成分也不一样，大的叶种茶所含的茶多酚、咖啡碱等有效物质较多，制成的茶味道浓烈。而小叶种相比之下成分较少一点，滋味淡薄些，但香气更高扬。