卖商业房的个人所得税的计算方法有两种，如果卖方在地税系统中能查询到房屋原值，则应按照计税价格减去房屋与安置减去原契税减去本次交易所缴纳税等合理费用再乘以20%可得。如果是卖方不能查询到房屋原值，则个人所得税为计税价格的1%。
一、卖商业房的个人所得税怎么算
卖商业房的个人所得税的计算方法有两种，采用哪种计算方法要根据具体的情况而定：
1.卖方能在地税系统中查到房屋原值，或能提供房屋原值等费用。
个人所得税＝（计税价格－房屋原值－原契税－本次交易所缴纳税等合理费用）×20％。
2.卖方不能在地税系统中查到房屋原值，也不能提供房屋原值等费用。
个人所得税计算方法为：个人所得税＝计税价格×1％。个人所得税＝计税价格×1％。
二、卖商业房个人所得税谁交
卖商业房个人所得税一般由卖家交纳。卖家需缴纳交易费、房款0.05%的印花税、差价5.5%（房产证未满2年）的增值税、房产交易盈利部分20%或者房款1%的个人所得税。
法律依据：
《个人所得税法》第三条 个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
三、个人所得税起征点是多少
个人所得税起征点是为5000元/月或60000万元/年。
1.工资范围在1-5k元之间的，包括5000元;
2.工资范围在5k-8k元之间的，包括8000元，个人所得税税率为3%;
3.工资范围在8k-17k元之间的，包括17000元，个人所得税税率为10%;
4.工资范围在17k-30k元之间的，包括30000元，个人所得税税率为20%;
5.工资范围在30k-40k万元之间的，包括4万元，适用个人所得税税率为25%;
6.工资范围在40k-60k元之间的，包括6万元，适用个人所得税税率为30%。