银杏雌雄株的早期鉴别，根据其株形、大枝角度、短枝形态等，有若干经验指标，但这些方法既缺乏明确标准，又由于树龄、地域、品种或类型等变化而难以应用。利用组织化学的方法有染色体形态鉴别法和过氧化物同功酶鉴定法。这两种方法虽较为可靠，但用起来很麻烦。从银杏生产的实际情况来看，早期能否判别植株的雌雄无关紧要，可以根据需要分别从成龄母株上采得接穗或分蘖苗，作定向繁殖或改接。
由于银杏雌雄异株，建园时必须考虑配植雄株作为授粉树。再者，银杏是风媒花，传粉距离远，花粉量大，因此，在建园时应将雄株栽在园子的迎风处，才能保证传粉授精。为了补救原有园雄株不足可在雌株上嫁接雄株。更有个别产地，传统以雄株根蘖苗建园，而后逐年逐层改接雌株，留少量雄枝，授粉效果更好。