【研究目的】分析茶树种质资源的遗传多样性，比较issr和trap在茶树中的标记效率；【方法】用12个issr引物和18个trap引物组合分别对11个茶树品种的基因组dna进行扩增；【结果】issr引物共产生61条带，多态性带占83．6％，遗传距离变化范围在0．231～0．707。trap引物共产生69条带，多态性带占79．7％，遗传距离变化范围为0．200～0．755。基于两种标记的聚类结果存在一定的差异，trap聚类结果能较好地体现供试品种的亲缘关系、地域特性和树型特点，与传统的基于形态特征建立的分类结果比较一致。在11个茶树品种间以及在亲缘关系比较近的黄旦、铁观音、毛蟹、白样观音4个品种间，issr的标记指数mi值都高于trap的mi值；【结论】issr具有更大的标记效率。也具有较高的多样性检测能力；trap比issr更适合于茶树特异种质资源和重要农艺性状的筛选。完成机构：[1]福建农林大学农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点开放实验室,福建福州350002 [2]福建教育学院,福建福州350025 [3]福建农林大学园艺学院,福建福州350002 [4]潍坊科技职业学院化学工程系,山东寿光262700