issr标记是一种基于微卫星序列发展起来的十分有效的分子标记。本文主要利用issr分子标记对我国39份茶树种质资源进行遗传关系研究，从40条引物中筛选出15条引物，共扩增出143个位点，其中多态性位点为131个，占91．6％。通过upgma聚类分析，39个茶树种质资源gs变化范围0．21～0．95，其中慢奇兰与竹叶奇兰gs值最大、遗传相似程度最高，遗传距离最近；崇庆枇杷茶与英红1号gs值最小、遗传相似程度最低、遗传学差异最大。聚类分析将39个种质资源划分为3个大类（gs=0．20），崇庆枇杷与英红1号，属于原始类型资源，归为一类；九龙珠与黄龙，属于较原始类型，也归为一类；其余的种质资源归为一类。据此认为，issr作为一种信息量高、重演性好的分子标记，应用于茶树遗传多样性和亲缘关系分析是非常有效。完成机构：[1]福建省农业科学院茶叶研究所,福建福安355015 [2]福建农林大学园艺学院,福建福州350002